U tom slučaju, pogledaj slijedeće stvari (nisam siguran koji backend bi debian koristio za automatski update niti koji ti koristiš):
/var/log/apt/
/var/log/aptitude
/var/log/dpkg.log
Pogledaj i arhivirane. Tu bi ti trebalo pisati sve što se instaliralo, konfiguriralo, deinstaliralo u sklopu paketnog sustava, pogotovo dpkg jer ga u pravilu svi GUI programčići direktno koriste...
Ova poruka je od: http://www.linux.hr/newbb/viewtopic.php?forum=4&topic_id=1763&post_id=10885